Guanidine Tiocyanate përdoret si biomjekësi, reagentë kimikë, etj. Mund të përdoret si agjent kaotropik dhe denaturant për të denatyruar dhe copëtuar qelizat, për të nxjerrë ARN dhe ADN dhe si adsorbent i DSSC për të përmirësuar shkallën e konvertimit të DSSC.