Guanidine Tiocyanate përdoret si biomjekësi, reagentë kimikë, etj.Mund të përdoret si agjent kaotropik dhe denaturant për të denatyruar dhe copëtuar qelizat, për të nxjerrë ARN dhe ADN dhe si adsorbues i DSSC për të përmirësuar shkallën e konvertimit të DSSC.